Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hacd1Q9QY80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hacd1Q9QY80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hacd1Q9QY80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hacd1Q9QY80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hacd1Q9QY80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hacd1Q9QY80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms