Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan3Q9QY33 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan3Q9QY33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan3Q9QY33 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tspan3Q9QY33 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tspan3Q9QY33 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tspan3Q9QY33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tspan3Q9QY33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan3Q9QY33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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Tspan3Q9QY33 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tspan3Q9QY33 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tspan3Q9QY33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan3Q9QY33 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tspan3Q9QY33 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan3Q9QY33 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
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