Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tinf2Q9QXG9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tinf2Q9QXG9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tinf2Q9QXG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tinf2Q9QXG9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tinf2Q9QXG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms