Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms