Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hacl1Q9QXE0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hacl1Q9QXE0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hacl1Q9QXE0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hacl1Q9QXE0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hacl1Q9QXE0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacl1Q9QXE0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hacl1Q9QXE0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms