Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sfmbt1Q9JMD1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sfmbt1Q9JMD1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sfmbt1Q9JMD1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Sfmbt1Q9JMD1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms