Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Actn2Q9JI91 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Actn2Q9JI91 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Actn2Q9JI91 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Actn2Q9JI91 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Actn2Q9JI91 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Actn2Q9JI91 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Actn2Q9JI91 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms