Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tm9sf3Q9ET30 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tm9sf3Q9ET30 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms