Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tm9sf3Q9ET30 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tm9sf3Q9ET30 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf3Q9ET30 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf3Q9ET30 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf3Q9ET30 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm9sf3Q9ET30 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf3Q9ET30 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf3Q9ET30 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms