Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER62

Tnfrsf22, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 22, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf22Q9ER62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf22Q9ER62 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf22Q9ER62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf22Q9ER62 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf22Q9ER62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf22Q9ER62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf22Q9ER62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf22Q9ER62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf22Q9ER62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf22Q9ER62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf22Q9ER62 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms