Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpr88Q9EPB7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpr88Q9EPB7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpr88Q9EPB7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpr88Q9EPB7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpr88Q9EPB7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms