Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms