Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg7Q9D906 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg7Q9D906 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg7Q9D906 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg7Q9D906 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg7Q9D906 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg7Q9D906 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg7Q9D906 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg7Q9D906 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms