Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec11cQ9D8V7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sec11cQ9D8V7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sec11cQ9D8V7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec11cQ9D8V7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec11cQ9D8V7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms