Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c6Q9D8P7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c6Q9D8P7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c6Q9D8P7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf3c6Q9D8P7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c6Q9D8P7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c6Q9D8P7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms