Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf13Q9D777 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13Q9D777 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13Q9D777 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfsf13Q9D777 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13Q9D777 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13Q9D777 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf13Q9D777 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13Q9D777 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms