Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tube1Q9D6T1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tube1Q9D6T1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tube1Q9D6T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tube1Q9D6T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tube1Q9D6T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tube1Q9D6T1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tube1Q9D6T1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tube1Q9D6T1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tube1Q9D6T1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tube1Q9D6T1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tube1Q9D6T1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tube1Q9D6T1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tube1Q9D6T1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms