Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubb4aQ9D6F9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb4aQ9D6F9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb4aQ9D6F9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubb4aQ9D6F9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubb4aQ9D6F9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb4aQ9D6F9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb4aQ9D6F9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb4aQ9D6F9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms