Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sdr42e1Q9D665 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sdr42e1Q9D665 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sdr42e1Q9D665 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdr42e1Q9D665 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sdr42e1Q9D665 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sdr42e1Q9D665 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdr42e1Q9D665 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sdr42e1Q9D665 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdr42e1Q9D665 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms