Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul5Q9D5V5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul5Q9D5V5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul5Q9D5V5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul5Q9D5V5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cul5Q9D5V5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cul5Q9D5V5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul5Q9D5V5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul5Q9D5V5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cul5Q9D5V5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul5Q9D5V5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul5Q9D5V5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cul5Q9D5V5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul5Q9D5V5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms