Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phf6Q9D4J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf6Q9D4J7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf6Q9D4J7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf6Q9D4J7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf6Q9D4J7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phf6Q9D4J7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.6 ms