Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stag1Q9D3E6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stag1Q9D3E6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stag1Q9D3E6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stag1Q9D3E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Stag1Q9D3E6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stag1Q9D3E6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stag1Q9D3E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stag1Q9D3E6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stag1Q9D3E6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stag1Q9D3E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stag1Q9D3E6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Stag1Q9D3E6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stag1Q9D3E6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stag1Q9D3E6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms