Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps33aQ9D2N9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps33aQ9D2N9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps33aQ9D2N9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33aQ9D2N9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33aQ9D2N9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps33aQ9D2N9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps33aQ9D2N9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33aQ9D2N9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33aQ9D2N9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33aQ9D2N9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps33aQ9D2N9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps33aQ9D2N9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms