Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef12Q9D2F1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pramef12Q9D2F1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pramef12Q9D2F1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramef12Q9D2F1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramef12Q9D2F1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef12Q9D2F1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pramef12Q9D2F1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms