Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eef1e1Q9D1M4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eef1e1Q9D1M4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eef1e1Q9D1M4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eef1e1Q9D1M4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eef1e1Q9D1M4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms