Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spc24Q9D083 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spc24Q9D083 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spc24Q9D083 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spc24Q9D083 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spc24Q9D083 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spc24Q9D083 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spc24Q9D083 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms