Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Q9CYI0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Q9CYI0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Q9CYI0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Q9CYI0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Q9CYI0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Q9CYI0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Q9CYI0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Q9CYI0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Q9CYI0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Q9CYI0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Q9CYI0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Q9CYI0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Q9CYI0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Q9CYI0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Q9CYI0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Q9CYI0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Q9CYI0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Q9CYI0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Q9CYI0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Q9CYI0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,7 ms