Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Malsu1Q9CWV0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Malsu1Q9CWV0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Malsu1Q9CWV0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Malsu1Q9CWV0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Malsu1Q9CWV0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Malsu1Q9CWV0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms