Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp5sQ9CRA7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5sQ9CRA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5sQ9CRA7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5sQ9CRA7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp5sQ9CRA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp5sQ9CRA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms