Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc2Q9CQP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc2Q9CQP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc2Q9CQP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc2Q9CQP2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc2Q9CQP2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc2Q9CQP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc2Q9CQP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms