Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TpbpbQ9CQC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TpbpbQ9CQC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TpbpbQ9CQC0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TpbpbQ9CQC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TpbpbQ9CQC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TpbpbQ9CQC0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TpbpbQ9CQC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TpbpbQ9CQC0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TpbpbQ9CQC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TpbpbQ9CQC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms