Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Atg3Q9CPX6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atg3Q9CPX6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atg3Q9CPX6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Atg3Q9CPX6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atg3Q9CPX6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Atg3Q9CPX6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atg3Q9CPX6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atg3Q9CPX6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atg3Q9CPX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atg3Q9CPX6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Atg3Q9CPX6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atg3Q9CPX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atg3Q9CPX6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atg3Q9CPX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Atg3Q9CPX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms