Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsmce3Q9CPR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce3Q9CPR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce3Q9CPR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsmce3Q9CPR8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce3Q9CPR8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce3Q9CPR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nsmce3Q9CPR8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nsmce3Q9CPR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsmce3Q9CPR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsmce3Q9CPR8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms