Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bbc3Q99ML1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bbc3Q99ML1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bbc3Q99ML1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bbc3Q99ML1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bbc3Q99ML1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bbc3Q99ML1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms