Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gins4Q99LZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gins4Q99LZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gins4Q99LZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gins4Q99LZ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gins4Q99LZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gins4Q99LZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins4Q99LZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms