Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsl24d1Q99L28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsl24d1Q99L28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsl24d1Q99L28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsl24d1Q99L28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms