Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arrdc1Q99KN1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arrdc1Q99KN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arrdc1Q99KN1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arrdc1Q99KN1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arrdc1Q99KN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms