Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa5aQ99KC8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vwa5aQ99KC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vwa5aQ99KC8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vwa5aQ99KC8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Vwa5aQ99KC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vwa5aQ99KC8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vwa5aQ99KC8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vwa5aQ99KC8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms