Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxp3Q99JB6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxp3Q99JB6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxp3Q99JB6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxp3Q99JB6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxp3Q99JB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxp3Q99JB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp3Q99JB6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms