Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apobec3Q99J72 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apobec3Q99J72 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Apobec3Q99J72 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apobec3Q99J72 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apobec3Q99J72 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apobec3Q99J72 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apobec3Q99J72 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apobec3Q99J72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apobec3Q99J72 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms