Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Derl1Q99J56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Derl1Q99J56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Derl1Q99J56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Derl1Q99J56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms