Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CsprsQ99388 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CsprsQ99388 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CsprsQ99388 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CsprsQ99388 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CsprsQ99388 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms