Protein–RNA interactions for Protein: Q922K7

Nop2, Probable 28S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop2Q922K7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop2Q922K7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop2Q922K7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nop2Q922K7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop2Q922K7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nop2Q922K7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nop2Q922K7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nop2Q922K7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nop2Q922K7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nop2Q922K7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nop2Q922K7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nop2Q922K7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop2Q922K7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms