Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Smc1bQ920F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smc1bQ920F6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smc1bQ920F6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smc1bQ920F6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smc1bQ920F6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smc1bQ920F6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smc1bQ920F6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc1bQ920F6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc1bQ920F6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smc1bQ920F6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms