Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdhga12Q91XY7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhga12Q91XY7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhga12Q91XY7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhga12Q91XY7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms