Protein–RNA interactions for Protein: Q91WK0

Lrrfip2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip2Q91WK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrfip2Q91WK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrfip2Q91WK0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrfip2Q91WK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrfip2Q91WK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrfip2Q91WK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrfip2Q91WK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrfip2Q91WK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrfip2Q91WK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrfip2Q91WK0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrfip2Q91WK0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrfip2Q91WK0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrfip2Q91WK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrfip2Q91WK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrfip2Q91WK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrfip2Q91WK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrfip2Q91WK0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrfip2Q91WK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrfip2Q91WK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrfip2Q91WK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.5 ms