Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pth2Q91W27 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pth2Q91W27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pth2Q91W27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pth2Q91W27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pth2Q91W27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pth2Q91W27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms