Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
RestQ8VIG1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
RestQ8VIG1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
RestQ8VIG1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
RestQ8VIG1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
RestQ8VIG1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
RestQ8VIG1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,52■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
RestQ8VIG1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,46■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
RestQ8VIG1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
RestQ8VIG1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,35■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
RestQ8VIG1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
RestQ8VIG1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
RestQ8VIG1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
RestQ8VIG1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
RestQ8VIG1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
RestQ8VIG1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
RestQ8VIG1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
RestQ8VIG1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms