Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpa1Q8VEE4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpa1Q8VEE4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpa1Q8VEE4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpa1Q8VEE4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpa1Q8VEE4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpa1Q8VEE4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpa1Q8VEE4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpa1Q8VEE4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa1Q8VEE4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa1Q8VEE4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpa1Q8VEE4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms