Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TgdsQ8VDR7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TgdsQ8VDR7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TgdsQ8VDR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TgdsQ8VDR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TgdsQ8VDR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TgdsQ8VDR7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TgdsQ8VDR7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms