Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam20bQ8VCS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam20bQ8VCS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20bQ8VCS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20bQ8VCS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20bQ8VCS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam20bQ8VCS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam20bQ8VCS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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