Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,1■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
V1ra11Q8R2E6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
V1ra11Q8R2E6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
V1ra11Q8R2E6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
V1ra11Q8R2E6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20,83■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
V1ra11Q8R2E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
V1ra11Q8R2E6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms