Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngr3Q8R191 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syngr3Q8R191 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syngr3Q8R191 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syngr3Q8R191 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngr3Q8R191 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syngr3Q8R191 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngr3Q8R191 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngr3Q8R191 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr3Q8R191 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr3Q8R191 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr3Q8R191 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr3Q8R191 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr3Q8R191 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms